Tras un fallido traspaso a la MLS, finalmente Matias Fernández fue anunciado con bombos y platillos como el nuevo refuerzo de Junior, equipo colombiano finalista de la última edición de la Copa Sudamericana. 

El ex volante del Cacique llega por un año desde Necaxa, dónde sus compañeros ya se despidieron públicamente de él. A través de sus redes sociales, Bryan Carvallo, otro ex albo, le dijo adiós con el siguiente mensaje:

"Siempre agradecido por cada palabra dentro y fuera de la cancha hermano ! ,éxito en lo que viene. #14 #crack"